Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Hdac5Q9Z2V6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Hdac5Q9Z2V6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac5Q9Z2V6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms