Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rps6ka4Q9Z2B9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6ka4Q9Z2B9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms