Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trip6Q9Z1Y4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trip6Q9Z1Y4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms