Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ilf3Q9Z1X4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ilf3Q9Z1X4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ilf3Q9Z1X4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms