Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Shcbp1Q9Z179 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Shcbp1Q9Z179 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms