Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpne6Q9Z140 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cpne6Q9Z140 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cpne6Q9Z140 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms