Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccl8Q9Z121 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccl8Q9Z121 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms