Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y1

Dctn3, Dynactin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn3Q9Z0Y1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Dctn3Q9Z0Y1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dctn3Q9Z0Y1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms