Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Itgb6Q9Z0T9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Itgb6Q9Z0T9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms