Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn13Q9Z0S4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn13Q9Z0S4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn13Q9Z0S4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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