Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slfn1Q9Z0I7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slfn1Q9Z0I7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms