Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clip2Q9Z0H8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clip2Q9Z0H8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms