Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pmfbp1Q9WVQ0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pmfbp1Q9WVQ0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms