Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slit3Q9WVB4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slit3Q9WVB4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms