Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp1a4Q9WV27 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp1a4Q9WV27 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms