Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUI0

Mixl1, Homeobox protein MIXL1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mixl1Q9WUI0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mixl1Q9WUI0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mixl1Q9WUI0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms