Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lemd3Q9WU40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Lemd3Q9WU40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Lemd3Q9WU40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms