Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pfdn5Q9WU28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pfdn5Q9WU28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms