Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Skp1Q9WTX5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Skp1Q9WTX5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Skp1Q9WTX5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms