Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PrkraQ9WTX2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PrkraQ9WTX2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms