Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vax2Q9WTP9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vax2Q9WTP9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax2Q9WTP9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax2Q9WTP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax2Q9WTP9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vax2Q9WTP9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms