Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mpdu1Q9R0Q9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mpdu1Q9R0Q9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms