Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Plod2Q9R0B9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Plod2Q9R0B9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms