Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nek3Q9R0A5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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Nek3Q9R0A5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nek3Q9R0A5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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