Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nubp2Q9R061 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nubp2Q9R061 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms