Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clcf1Q9QZM3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Clcf1Q9QZM3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms