Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp21Q9QZL6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Usp21Q9QZL6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Usp21Q9QZL6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms