Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ercc4Q9QZD4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ercc4Q9QZD4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ercc4Q9QZD4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms