Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn8Q9QZ49 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn8Q9QZ49 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn8Q9QZ49 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms