Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tnnt3Q9QZ47 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tnnt3Q9QZ47 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms