Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI7

Dnajb8, DnaJ homolog subfamily B member 8, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb8Q9QYI7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajb8Q9QYI7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Dnajb8Q9QYI7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnajb8Q9QYI7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajb8Q9QYI7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms