Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ptf1aQ9QX98 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ptf1aQ9QX98 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms