Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUP5

Hapln1, Hyaluronan and proteoglycan link protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln1Q9QUP5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hapln1Q9QUP5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hapln1Q9QUP5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hapln1Q9QUP5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hapln1Q9QUP5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hapln1Q9QUP5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms