Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tlr4Q9QUK6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlr4Q9QUK6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms