Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cln8Q9QUK3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cln8Q9QUK3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms