Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neu3Q9JMH7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neu3Q9JMH7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neu3Q9JMH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neu3Q9JMH7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neu3Q9JMH7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Neu3Q9JMH7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms