Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SrfQ9JM73 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrfQ9JM73 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms