Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Tnfrsf19Q9JLL3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Tnfrsf19Q9JLL3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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