Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pkd2l2Q9JLG4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkd2l2Q9JLG4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms