Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CubnQ9JLB4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms