Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmx1aQ9JKU8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmx1aQ9JKU8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmx1aQ9JKU8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms