Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nova1Q9JKN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nova1Q9JKN6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms