Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AtrQ9JKK8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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AtrQ9JKK8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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AtrQ9JKK8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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AtrQ9JKK8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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AtrQ9JKK8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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AtrQ9JKK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
AtrQ9JKK8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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