Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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Tmod2Q9JKK7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmod2Q9JKK7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmod2Q9JKK7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Tmod2Q9JKK7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms