Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Stx6Q9JKK1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stx6Q9JKK1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stx6Q9JKK1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms