Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Trem1Q9JKE2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Trem1Q9JKE2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms