Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Oxct2aQ9JJN4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Oxct2aQ9JJN4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms