Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rpf2Q9JJ80 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpf2Q9JJ80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms