Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp1r3fQ9JIG4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r3fQ9JIG4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms