Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LratQ9JI60 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LratQ9JI60 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms